1.新生奖学金

被北京交通大学录取的直博生，一年级可获得国家奖学金20000元/生年。被北京交通大学录取的其他硕士推免生（包括学术学位和专业学位），一年级可获得一等奖学金12000元/生年。
2.高年级奖学金
二年级及以上硕士研究生可申请国家奖学金及学业奖学金，国家奖学金20000元/生年，一等奖学金12000元/生年（国家奖学金和一等奖学金占比40%）。二年级及以上博士研究生可申请国家奖学金及学业奖学金，国家奖学金30000元/生年，一等奖学金16000元/生年（国家奖学金和一等奖学金占比40%）。
3.“2011计划”圆梦高铁专项奖学金
被北京交通大学录取的直博生，如其导师为“2011计划”“轨道交通安全协同创新中心”人员，可享受“2011计划”圆梦高铁专项奖学金10000元。
4.知行奖学金
知行奖学金设知行奖和提名奖，知行奖20000元/人次，提名奖10000元/人次。优秀博士、硕士研究生均可申请。
5.双百奖学金
双百奖学金即马克思主义理论专业研究生新生奖学金、学术奖学金，新生奖学金每人奖励20000元，学术奖学金每人奖励30000元，马克思主义理论专业优秀博士、硕士研究生均可申请。
6.助学金
北京交通大学全日制非定向硕士研究生（包含学术学位和专业学位），资助范围内每人每年享受国家助学金6000元。全日制非定向博士研究生，资助范围内每人每年享受国家助学金18000~21000元。
7.社会捐助奖助学金
北京交通大学设立各种社会捐助奖助学金共30余项，研究生攻读学位期间均可申请，奖励金额每人2000-30000元。
8.助管、助教、助研
北京交通大学设立研究生助管和助教岗位，聘用的博士、硕士研究生按岗位及工作时间发放津贴。另外，博士研究生由导师资助助研费，工学不低于800元/生月，理学、经管不低于500元/生月，人文不低于300元/生月。