根据《财政部国家发展改革委教育部关于完善研究生教育投入机制的意见》（财教〔2013〕19号）精神，2014年秋季学期起，研究生教育实行“收费+奖助学金”制度。安徽医科大学积极推进研究生奖助体系改革，构建“奖优、助困、酬劳”有机结合的“差异化、动态激励机制”，参见《安徽医科大学研究生奖助体系简介》。被安徽医科大学录取的推荐免试生，第一学年直接评为一等学业奖学金。
收费标准（全日制与非全日制收费标准一致）：