西南医科大学临床医学、口腔医学和中医类专业学位研究生全部和住院医师规范化培训结合，凡报考上述专业学位的研究生必须无条件参加住院医师规范化培训，研究生须获得“执业医师资格证书”及“住院医师规范化培训合格证书”后方可申请学位。
临床医学、口腔医学、中医类专业学位招收符合临床执业医师报考资格条件规定的应届或往届本科毕业生（注：在研究生学习阶段不能报考本专业的执业医师证的学生不能报考临床、中医和口腔专业学位研究生）。
对于已经获得规培证书的人员不得报考临床医学、口腔医学、中医学硕士专业学位研究生，只能报考学术学位研究生。
参加了国家级卫生行政部门批准的规培基地“规培未结业的人员”跨专业考上专业学位研究生，需重新规培学习；同专业学生的规培时间可以进行适当减免。