中国科学院近代物理研究所的毕业生就业实行双向选择，社会认同度和就业率高。‌ 优秀推荐免试本科生经遴选可直接攻读博士学位，优秀硕士生经选拔可硕博连读。毕业生就业方向广泛，包括但不限于原子核物理、原子分子物理、放射生物学、核材料与工艺技术、乏燃料后处理技术等领域。该所还提供就业指导，帮助学生根据国家需要和个人实际情况选择职业。此外，博士研究生年薪约为20万，发放20万安家费；优秀硕士年薪约为15万。工作地点主要在广东惠州和甘肃兰州‌12。 中国科学院近代物理研究所的毕业生由于对就业政策缺乏了解，择业时往往在思想上带有很大的随意性和盲目性。因此，通过就业指导，广泛宣传就业政策，引导学生走出择业的“误区”，使学生能够根据国家需要并结合个人实际有针对性地选择职业，对于提高毕业生的就业质量和满意度具有重要意义‌。

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